Ministerstvo životního prostředí bude poslance znovu žádat, aby schválili vznik chráněných území evropského typu Natura. Novelu zákona o ochraně přírody a krajiny, která měla vytyčení nových chráněných lokalit umožnit, sněmovna zamítla počátkem listopadu. Ministerstvo řízené lidovcem Liborem Ambrozkem proto začalo pracovat na jiném zákoně, připraveno je podpořit i případnou poslaneckou iniciativu. Dnes to řekla mluvčí úřadu Karolína Šůlová.
Odpůrci novely, především z řad ODS, se domnívají, že zřízení rezervací by se dotklo vlastnických práv občanů. Na druhé straně ale stát čekají kvůli neexistenci rezervací sankce EU. Natury se také týkala jediná "ekologická" výtka Evropské komise vůči ČR v poslední hodnotící zprávě připravenosti přistupujících zemí.
"Pokud Česko nezajistí zakotvení soustavy do svého právního řádu, zahájí EK okamžitě po datu vstupu proti naší republice proces pro neúplnou transpozici příslušných směrnic společenství," tvrdí náměstek ministra životního prostředí Ladislav Miko. Ještě v roce 2004 by podle něj komise podala žalobu k Evropskému soudnímu dvoru, následovala by další soudní řízení o sankcích. Dosahují vysokých čísel, třeba Řecko zaplatilo za nedodržení ekologické legislativy v roce 2000 několik milionů eur.
Poslanci tím, že nesouhlasili s novelou, podle Mika ohrozili také čerpání finančních prostředků z evropských fondů na infrastrukturní projekty, například i na rozšíření terminálu letiště Praha-Ruzyně. Žádosti o finanční podporu z fondů EU totiž musí obsahovat závazné potvrzení, že projekt nebude mít negativní vliv na lokality soustavy Natura 2000. Pro takové závazné potvrzení je ale nutné, aby Natura v zemi existovala. Žádosti, které závazné potvrzení mít nebudou, bude komise považovat za nevyhovující. "To se bude týkat všech projektů, tedy i těch, které nemají s Naturou žádnou souvislost a jsou prokazatelně ve veřejném zájmu," uvedl Miko.
Po neúspěchu s novelou zákona o přírodě a krajině začalo ministerstvo pracovat na takzvaném zákoně o ptačích oblastech a na vypracování národního seznamu podle směrnice o stanovištích. Předpisy budou mít stejnou funkci jako odmítnutá novela. Druhou možností, jak ve sněmovně uspět, je dohoda s některými poslanci na jejich vlastní iniciativě. Formulace směřující k zavedení soustavy do českého práva by se tak mohly objevit i v některém jiném připravovaném ekologickém zákoně.
Hlavním smyslem Natury je zachování biologické rozmanitosti a nejdůležitějších přírodních lokalit v celé EU. Ochrana území v lokalitách Natura bude měkčí než v dosavadních rezervacích, například zemědělci však budou muset v nových rezervacích upravit své hospodaření. Na kompenzace pro ně počítalo ministerstvo zhruba se 100 miliony korun ročně.